Phase genomics
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ProxiMeta™ Hi-C Metagenomics Platform
ProxiMeta™ Hi-C Metagenomics Platform
Phase Genomics
ProxiMeta™ Hi-C Metagenomics Platform
Genome-resolved microbiome analysis를 위한 Hi-C 기반 metagenomics solution
ProxiMeta™는 Hi-C proximity ligation technology를 활용하여 complex microbiome sample에서 microbial genome reconstruction, plasmid-host linkage, phage-host interaction 분석을 지원하는 advanced metagenomics platform입니다.
Product Overview
What is ProxiMeta™?
ProxiMeta™ Hi-C Metagenomics Platform은 complex microbial community 내에서 genome-resolved metagenomics 분석을 수행하기 위한 솔루션입니다.
기존 shotgun metagenomics만으로는 구분하기 어려운 plasmid-host 관계, phage-host relationship, MAG contamination 문제를 Hi-C proximity signal을 통해 보완할 수 있습니다.
Best Fit For
- Microbiome research
- Metagenome deconvolution
- MAG reconstruction
- Plasmid-host attribution
- Phage-host interaction
- AMR gene tracking
- Environmental genomics
Key Benefits
Complex microbiome에서 개별 microbial genome reconstruction을 지원합니다.
Plasmid가 어떤 microbial host와 연결되는지 분석하는 데 도움을 줍니다.
Phage-host interaction 및 microbial ecology 연구에 활용 가능합니다.
MAG binning accuracy 개선 및 contamination 감소에 기여할 수 있습니다.
Recommended Applications
Gut Microbiome
복잡한 장내미생물 community에서 strain-level genome reconstruction 및 host association 분석에 활용됩니다.
Environmental Genomics
Soil, marine, wastewater 등 복합 환경 sample의 microbial community 분석을 지원합니다.
AMR Tracking
Antimicrobial resistance gene이 어떤 host organism과 연결되는지 연구하는 데 활용될 수 있습니다.
Phage-host Interaction
Bacteriophage와 microbial host 간의 관계 분석에 적합합니다.